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kegg通路分析学术下载_kegg通路分析学术有哪些(2024年11月最新版)

内容来源:AI全自动内容创作接口所属栏目:新闻更新日期:2024-11-29

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科研效率翻倍!必备工具大揭秘 𐟚€ 在科研的道路上,效率就是生命!很多时候,我们因为不知道某些便利工具的存在,而浪费了宝贵的时间。今天,我要给大家介绍一个超级实用的网站——SciBank,它汇集了众多在线工具,可以帮助你轻松收集学术资料、进行英语纠错、数据库查询、蛋白与核酸分析等。遇到科研问题时,先别急着动手,看看有没有现成的工具可以帮你,效率绝对翻倍!𐟒ከ𕄦–™收集:海量资源任你挑 资料收集是科研的基础。除了大家熟知的PubMed和谷歌学术,还有一些高校和专利的收集工具,比如JAIRO和Apollo。此外,还有各种数据库,比如信号通路数据库KEGG、蛋白与小分子对接数据库BindingDB、高分子建模软件库ROSIE等。这些工具在各个领域内都能提供丰富的数据资源。𐟓š 科研助手:节省你的宝贵时间 在科研过程中,一些小工具能帮你节省大量时间。比如,免费的Grammarly可以帮你进行语法纠错,Matcha可以将公式转换成Latex格式,还有一些格式、公式、名词分析工具,在关键时刻真的能救你一命!𐟕’ 计算软件:生物化学信息学神器 生物信息学工具如MHCpred可以预测多肽与组织相容性,化学信息学工具如DockRMSD可以进行在线对接,中药靶点数据库TTD和通用化学AI框架DeepChem也是被广泛验证过的便利工具。将这些工具收入你的工具箱,绝对没错!𐟔슊总之,科研效率的提升离不开这些实用工具的帮助。赶紧去试试这些网站和工具吧,让你的科研之路更加顺畅!𐟌Ÿ

网络药理学:从零开始到发表SCI的指南 网络药理学其实并没有大家想象的那么高深莫测。今天,我就来分享一些我自己学习网络药理学时用到的各种资料,希望能帮到大家。 网络药理学的基础概念 𐟌 网络药理学是基于药物与药物之间在结构、功效等方面的相似性,以及机体内靶标分子和生物效应分子的多种相互作用关系,通过构建药物-药物、药物-靶标等网络来预测药物的功效以及特定功效对应的药物。简单来说,就是通过分析药物之间的相互作用关系来理解药物的疗效。 中药网络药理学的分析思路 𐟌🊊中药网络药理学主要基于中药复方,利用系统生物学与系统药理学的原理,研究中药的多成分、多靶点特点。分析思路通常分为三步: 第一步:找到有效靶点。通过数据库、文本挖掘或软件预测等手段找到某方剂、药对或中药中的有效靶点。这一步的加分项是通过计算机模拟和体外实验(如SPR分析、Biocore)等验证药物小分子与靶分子之间的作用位点。 第二步:筛选靶分子相关的生物学功能和分子通路。通过GO/KEGG富集分析来筛选靶分子相关的生物学功能和分子通路。 第三步:构建互作网络。可以是药物-活性成分-相关生物学功能/通路之间的互作网络,也可以是活性成分-相关生物学功能/通路-表型/疾病之间的互作网络,甚至是靶分子之间的互作网络。这一过程中的每一步的预测,也可以根据预测网站或软件等分析工具加上对应的统计值表格。 干湿结合的中药网络药理学研究 𐟒簟”劊这类研究侧重于实验研究,一般IF在3-5分之间。把网络药理学当作筛选靶基因、相关生物学功能、通路的预测手段,也是按三步走的策略,每一步再通过常规的分子生物学、细胞生物学的技术加以验证。 网络药理学与生信结合的分析套路 𐟓Š𐟌 这类研究把生信分析套路和网络药理学套路有机结合,一般IF在1-6分左右。第一步是通过数据库、文本挖掘或软件预测等手段找到某方剂、药对或中药中的有效靶点。这一步的加分项是通过计算机模拟和体外实验(如SPR分析、Biocore)等验证药物小分子与靶分子之间的作用位点。 网络药理学做图软件 𐟖寸 常用的网络药理学做图软件有三个,分别是Cytoscape、Gephi和VisANT。这些软件可以帮助你更好地理解和可视化药物之间的相互作用关系。 网络药理学相关文献 𐟓– 网络上有很多关于网络药理学的文献,可以通过数据库或学术期刊网站进行搜索和下载。这些文献可以为你提供更多的研究思路和方法参考。 TCMSP中药网络药理学资料 𐟌🊊TCMSP(中药系统药理学数据库)提供了大量的中药网络药理学资料,包括KEGG通路富集分析、GO功能富集分析等视频教程和脚本文件。这些资料可以帮助你更好地理解和应用中药网络药理学。 总结 𐟓 网络药理学并不是高不可攀的学问,只要掌握了基本的概念和分析思路,再加上一些实用的工具和资料,你也能轻松上手。希望这篇指南能帮到你,祝你早日在SCI上发表自己的研究成果!

网络药理学学习资料大放送,轻松掌握! 𐟎“ 曾经花费5000元购买的网络药理学资料,现在免费分享给大家!这些资料对我帮助巨大,现在用不到了,希望对你们也有帮助。 𐟓š 网络药理学其实并不复杂,三天就能入门。以下是部分资料内容: 网络药理学做图软件(3个) 网络药理学相关文献 网络药理学系列一(共11讲) 网络药理学系列二(共14讲) 网络药理学系列三(共15讲) 𐟒Š 特别推荐:TCMSP中药网络药理学资料,包括14个视频,涵盖KEGG通路富集分析、GO功能富集分析、symbol转换为基因id、PPI网络核心基因、PPI网络构建以及中药网络药理学可视化等多个方面。 𐟓‚ 这些资料不仅适合初学者,也适合有一定基础的药理学家。快来下载,开启你的网络药理学之旅吧!

8k网络药理学教程免费分享,快来领取! 大家好,今天我要和大家分享一份价值8k的网络药理学教程,真的是医学科研大佬们的结晶啊!经过一番努力,我终于学完了这些内容,现在整理出来分享给大家,绝对的白嫖福利哦! 网络药理学教程概览 𐟓š 首先,这个教程包括了三个部分的详细内容:网络药理学做图软件、网络药理学相关文献以及一系列的网络药理学讲座。具体来说: 网络药理学做图软件(3个) 这些软件可以帮助你更好地进行网络药理学的可视化操作。 网络药理学系列讲座 这个部分包含了多个讲座,从基础到进阶,适合不同层次的研究人员。 网络药理学相关文献 这些文献都是最新的研究成果,可以帮你了解最新的研究动态。 详细内容展示 𐟓– 接下来,我会详细介绍一下教程中的一些关键内容: KEGG富集分析.mp4 - 344.19MB GO功能富集分析.mp4 - 285.56MB 基因名字转换成基因id的脚本 - 182.36MB 药物调控网络.mp4 - 332.46MB cytoscape输入文件准备.mp4 - 179.45MB 蛋白互作PP网络构建.mp4 - 290.22MB 多个化合物处理.mp4 - 266.3MB TCMSP中药网络药理学资料 𐟌🊊此外,教程中还特别提到了TCMSP中药网络药理学资料,这部分内容非常适合中药研究者。具体包括: KEGG通路富集分析(走脚本) - 223.09MB GO功能富集分析(走脚本) - 237.3MB symbol转换为基因id(走脚本) - 136.98MB PPI网络核心基因(走脚本) - 181.73MB PPI网络构建 - 238.77MB 中药网络药理学可视化 - 304.1MB 总结 𐟓 这份教程真的是涵盖了网络药理学的方方面面,从基础到进阶,从软件到实践,内容非常丰富。希望这份教程能对大家有所帮助,赶紧下载学习吧!如果有任何问题,欢迎在评论区留言,我会尽力解答。祝大家科研顺利!

网络药理学资料大放送,药理学必备! 终于有大佬整理出了网络药理学的详细资料,赶紧分享给大家,不用白嫖! 𐟓Š 网络药理学做图软件(3个) 【网络药理学】相关文献 【网络药理学】系列一(共11讲) 【网络药理学】系列三(共15讲) 【网络药理学】系列二(共14讲) 𐟓‚ 网络药理学资料(zip文件) KEGG富集分析.mp4 GO功能富集分析.mp4 基因名字转换成基因id(脚本安装) 药物调控网络.mp4 Cytoscape输入文件准备.mp4 蛋白互作PP网络构建.mp4 多个化合物处理.mp4 𐟌🠔CMSP中药网络药理学资料 TCMSP中药网络药理学资料.zip KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PP网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 𐟔 详细内容 14. KEGG通路富集分析(走脚本) 13. GO功能富集分析(走脚本) 12. symbol转换为基因id(走脚本) 11. PPI网络核心基因(走脚本) 10. PPI网络构建 09. 中药网络药理学可视化 08. Cytoscape输入文件准备(走脚本) 07. 药物靶点和疾病靶点交集(走脚本) 这些资料涵盖了网络药理学的各个方面,从基础到进阶,适合各个层次的药理学爱好者。赶紧下载学习吧!𐟓š

USP7新发现:促GBM凋亡 𐟓Š 泛素化修饰在蛋白质翻译后修饰中扮演着重要角色,其中USP7抑制剂P5091对GBM细胞的凋亡具有显著影响。通过不同浓度的P5091处理GBM细胞,发现细胞活力随时间和浓度呈现依赖性下降。在处理48小时后,SHG-140和T98G细胞的半抑制浓度分别为1.2和1.59。随着P5091浓度的增加,GBM细胞的早期、晚期凋亡和总凋亡均显著增加。 𐟔젨🛤𘀦�š„研究表明,P5091处理后,GBM细胞中BCL2蛋白表达显著降低,而BAX和caspase3蛋白表达则显著增加。这些结果与免疫荧光的结果一致,表明P5091对GBM细胞具有明显的促凋亡作用,且其凋亡作用随浓度的增加而增加。 𐟔 为了探究USP7诱导GBM细胞凋亡的机制,作者使用Co-IP和LC-MS/MS结合的方法鉴定了SHG-140细胞中的USP7结合蛋白。鉴定出的蛋白与KEGG通路分析显示,USP7与蛋白酶体功能高度相关。通过对蛋白提取物进行TMT蛋白质组学分析,发现368种蛋白质的含量发生了变化,其中227种蛋白质增加,141种蛋白质减少。 𐟓Š 最终,作者成功筛选了ARF4,一种与USP7抑制剂结合的蛋白,并提出了USP7通过蛋白酶体途径感染ARF4的假设。这些发现为泛素化修饰在GBM细胞凋亡中的机制研究提供了新的线索。

GEO数据库生信分析全攻略 GEO数据库生信分析是一种强大的工具,可以帮助我们理解生物数据。以下是详细步骤: 差异表达分析 𐟓Š 通过先进的算法,我们可以找到在不同条件下表达水平有显著差异的基因。 表达矩阵整理 𐟓ˆ 将数据集的探针ID进行转换,合并去批次,整理成表达矩阵。 火山图和热图绘制 𐟔加 基于limma分析或counts分析,绘制火山图和热图,直观展示差异表达情况。 富集分析 𐟌 进行GSEA、ssGSEA、GSVA等富集分析,揭示基因的生物学功能。 GO和KEGG通路分析 𐟛䯸 通过GO和KEGG通路分析,了解基因在细胞通路中的位置和作用。 免疫浸润和转录因子分析 𐟧ꊠ 研究免疫细胞的浸润情况和转录因子的表达模式。 网络突变分析 𐟌 利用WGCNA方法构建基因表达网络,进行网络突变分析。 CNV分析 𐟔 检测基因组的拷贝数变异,了解基因组结构的变化。 聚类分析 𐟓ˆ 通过聚类分析,将表达模式相似的基因或样本聚在一起。 敏感性分析 𐟧ꊠ 评估不同条件下的敏感性,了解实验结果的可靠性。 多种数据库支持 𐟌 支持多种公共数据库,包括TCGA、ICGC、GEO、UCSC等,确保分析的全面性和准确性。 生信作图 𐟎芠 提供高质量的科研作图,帮助您直观展示分析结果。 结果解读及解惑 𐟤” 提供详细的分析报告,帮助您理解复杂的生信数据。 指导专业解读 𐟑袀⚕️ 对mRNAsi、C50和干性指数等先进指标提供专业解读。 生信分析医学留学生咨询 𐟌 为医学留学生提供生物信息学咨询,指导生信分析和SCI写作。 孟德尔随机化辅导 𐟧슠 提供孟德尔随机化定题、TWAS、SMR、PWAS、COLOC、PPIMR等分析服务。 线性和非线性MR分析 𐟓ˆ 进行线性和非线性孟德尔随机化分析,了解基因与疾病的关系。 暴露疾病、睡眠神经方向研究 𐟌쯸 研究环境暴露与疾病的关系,以及睡眠和神经系统的相关研究。 肿瘤甲基化影响 𐟒Š 探索肿瘤中甲基化对基因表达的影响。 通过这些步骤,我们可以更深入地理解生物数据,为科学研究提供有力支持。

8k元网络药理学教程免费分享 这些资料是医学科研大佬们精心整理的,经过一番努力终于学完了,现在分享给大家,绝对免费哦! 网络药理学教程概览 𐟓š 网络药理学教程用不到了,分享给大家,拿走不谢! 网络药理学系列一(共11讲) 𐟓– KEGG富集分析.mp4 GO功能富集分析.mp4 基因名字转换成基因id(脚本安装) 药物调控网络.mp4 Cytoscape输入文件准备.mp4 蛋白互作PP网络构建.mp4 多个化合物处理.mp4 网络药理学系列二(共14讲) 𐟓– KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) Symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 网络药理学系列三(共15讲) 𐟓– KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) Symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 额外资料 𐟓 TCMSP中药网络药理学资料.zip KEGG通路富集分析(走脚本) GO功能富集分析(走脚本) Symbol转换为基因id(走脚本) PPI网络核心基因(走脚本) PPI网络构建.mp4 中药网络药理学可视化.mp4 Cytoscape输入文件准备(走脚本) 药物靶点和疾病靶点交集(走脚本) 总结 𐟓 这些教程涵盖了网络药理学的多个方面,从基础到进阶,适合各个层次的科研人员。希望这些资料对大家有所帮助!

如何解读KEGG气泡图❓ 𐟔气泡图是一种用于展示不同生物学通路在富集分析中的结果的图表。通过分析这种图,可以观察到与特定疾病或条件相关的生物学通路。 𐟔‘例如,PI3K-Akt信号通路和JAK-STAT信号通路的气泡较大且颜色偏红,这表明这些通路在富集分析中非常显著,并且涉及到的基因数量较多。 𐟓Š如何制作气泡图: 1️⃣ 数据收集:首先需要一组数据,包含你想在图表中展示的各项指标。 2️⃣ 统计分析:使用统计方法,如富集分析,来确定每个生物学通路中显著基因的数量以及相关的P值。 3️⃣ 图形生成:利用绘图软件或编程语言(如R、Python等),根据收集到的数据绘制气泡图。 4️⃣ 分析气泡图的结果 5️⃣ 寻找显著的通路:寻找那些气泡大且颜色深的通路。这表示在这些通路中不仅有较多的基因表现出显著的活动,而且统计显著性也高。 6️⃣ 了解通路功能:识别这些显著的通路后,研究者会进一步探索这些通路在疾病或生理过程中的具体作用。 7️⃣ 比较不同通路:比较各个通路之间的显著性和基因数量,可以帮助研究者了解哪些通路可能在研究的条件下起主导作用。 𐟑‡留下你的方向,我来看看思路

网络药理学学习资料大公开,轻松掌握! 𐟎“ 终于有人整理好了网络药理学的宝贵资料,快来看看吧! 𐟓Š 网络药理学做图软件:3个必备工具,让你的研究更上一层楼! 𐟓š 网络药理学相关文献:深入了解网络药理学的理论基础。 𐟎젧𝑧𛜨類†学系列一(共11讲):从基础到进阶,带你全面掌握网络药理学。 𐟎젧𝑧𛜨類†学系列二(共14讲):深入探讨网络药理学的实际应用。 𐟎젧𝑧𛜨類†学系列三(共15讲):涵盖网络药理学的最新研究成果。 𐟓‚ 网络药理学zip文件:包含所有关键资料,方便下载和学习。 𐟎堨熩⑦•™程:详细讲解网络药理学的重要概念和方法。 𐟒Š 中药网络药理学资料:专为中药研究设计的网络药理学资源。 𐟓ˆ 数据分析工具:提供KEGG通路富集分析和GO功能富集分析等强大工具。 𐟓Š 基因名字转换脚本:将基因名字转换为基因ID,方便进行后续分析。 𐟎蠨柳騰ƒ控网络视频:展示药物如何通过调控网络影响生物过程。 𐟖寸 Cytoscape输入文件准备:教你如何准备Cytoscape所需的输入文件。 𐟤 蛋白互作网络构建:构建蛋白质相互作用网络,揭示生物过程的复杂性。 𐟔 多个化合物处理:处理多个化合物,分析它们对网络的影响。 𐟌🠔CMSP中药网络药理学资料:专为中药研究设计的网络药理学资源。 𐟓ˆ TCMSP中药网络药理学资料.zip:包含所有关键资料,方便下载和学习。 𐟎堔CMSP中药网络药理学视频教程:详细讲解中药网络药理学的关键概念和方法。 𐟒Š 中药网络药理学可视化:将中药的网络药理学研究结果可视化,直观展示药物的作用机制。 𐟓Š PPI网络核心基因:找出PPI网络中的核心基因,深入了解它们在网络中的作用。 𐟔 PPI网络构建:构建PPI网络,揭示蛋白质之间的相互作用关系。 𐟌🠤𘭨什‘络药理学可视化:将中药的网络药理学研究结果可视化,直观展示药物的作用机制。 𐟓ˆ 药物靶点和疾病靶点交集:找出药物靶点和疾病靶点的交集,深入了解药物的作用机制。 𐟎堧𝑧𛜨類†学视频教程:详细讲解网络药理学的关键概念和方法,帮助你快速上手。 𐟓‚ 网络药理学资料下载:提供所有关键资料的下载链接,方便学习和使用。

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